El masaje sobre los chakras aplicado con aceites esenciales actúa en los constituyentes físicos del cuerpo y promueve la asimilación de estas sustancias a través de los vórtices energéticos de acceso. También impulsa su trayecto a lo largo de los nadis o canales energéticos que desembocan en los distintos órganos correspondientes. A lo anterior se añade un efecto dinamizador de las energías sutiles.
Una de las maneras más efectivas de aplicación consiste en masajear suavemente las zonas con el dedo pulgar derecho, en el sentido de las agujas del reloj, haciendo un número de giros en ciclos de siete o múltiplos de siete.